Hola que tal, buenas tardes, tengo experiencia en administración de servidores, pero vi que comentaste que tu sitio actual es un wordpress, seguramente el foco de la infección esta en los archivos centrales de tu tema o algún plugin.
Puedo ayudarte a dejarlos completamente limpios y optimizados, el problema con este tipo de sitios, es que cuando se infectan, los virus se almacenan en la base de datos. Espero tu respuesta, saludos!