Saludos! Soy especialista en linux y en sistemas almacenamientos locales y por red. Tengo la capacidad y conocimientos necesarios para solventar su inconveniente.
Este problema se origina debido a que php utiliza generalmente la ruta /var/*/session para almacenar las sesiones de usuario. El problema en sí podría residir en que alguno de sitios web no maneja adecuadamente las sesiones o la destruye cuando es requerido. Las soluciones pueden ser muy variadas, he aquí ofrezco soluciones:
1) Crear un script que destruya las sesiones invalidas y/o antiquisimas
2) Incrementar el espacio de almacenamiento de su servidor (podría generar gastos adicionales con su proveedor de servicio)
3) Implementar de forma mixta la solución 1 y 2
Puedo completar las soluciones antes mencionadas por un precio base de 30 USD. Adicionalmente podría depurar su página web para optimizar el manejo de sesiones, aunque el precio podría variar.
Sobre su proyecto, ha sido muy claro sobre su requerimiento, pero aún así tengo una duda: ¿utiliza usted un CMS como prestashop, magneto, wordpress?, por favor, escribame por chat para poder conversar los detalles.