Si tu hosting es compartido, entomces hay que utilizar una opción que se llama crontab más un pequeño programa que ejecute las instrucciones necesarias.
En esenia crontab es una aplicación propia del sistema que permite la ejecución periódica de otro programa según la frecuencia que uno determine.
En este caso, crontab ejecutaría el programa que uno le indicase que sería el que borraría los archivo a definir.
Así, para realizar este trabajo se necesita:
a) Frecuencia de ejecución: ¿cada cuántos minutos, horas, días, semanas, meses se ejecutaría el programa? esto puede ser tan granular como minutos hasta meses.
b) ¿Qué se borrará? esto es, ¿cuál es la característica del archivo a borrar? ¿son archivos con "n" días de antiguedad? ¿son archivos mayores a "n" tamaño?
Con esto en mano, puedo ayudarte a realizar el trabajo sin ningún problema.
Abierto a preguntas.